В верхней части главного окна Cerebro располагается Основная панель инструментов, с её помощью можно увидеть путь к задаче, а также работать с инструментами для индикации задач, навигации и обновления.
Панель содержит следующие кнопки (слева направо):
Пометить критичные задачи — выделяет красным цветом в списках те задачи, для которых не соблюдены важные показатели (временные, денежные);
Кнопка индикации событий («лампочка») — отображает количество новых событий (непрочитанных сообщений) в системе, при нажатии на неё можно быстро перейти к их просмотру;
Менеджер задач — инструмент для управления структурой проектов, исполнения различных операций над задачами, сообщениями и вложениями;
Обновить — обновляет содержимое окон Cerebro;
Назад, Вперед и Поле ввода адресной строки задач — управление навигацией по задачам;
Кнопка-индикатор службы Cargador — отображает значками текущее состояние службы Cargador — файлового менеджера, при нажатии на неё открывает окно управления данным сервисом.
Основная панель инструментов зафиксирована. Дополнительные панели инструментов подвижны, их можно скрыть/показать через главное меню, переместить или расположить вертикально в боковой части окна.